抗癌伴孢晶體蛋白的結構生物學（開題報告）

大學本科畢業(yè)論文(設計)開題報告
學院：化工學院 　　　　　　　　　　　　　專業(yè)班級：生物工程一班

課題名稱 抗癌伴孢晶體蛋白的結構生物學

1、本課題的的研究目的和意義：

目的：本研究在已有的研究基礎上，利用蛋白結構預測手段，對突變蛋白質P11、P32的以及未突變蛋白P2Y的空間結構進行預測，以推測P11、P32、P2Y的3D空間結構，再進行P11、P32與P2Y二級結構和三級結構間的比較，找出異同點，為今后進一步確定其抗癌構效關系的研究奠定基礎。

意義：蘇云金芽孢桿菌（Bacillus thuringiensis，簡稱Bt）是一種分布及其廣泛的革蘭氏陽性細菌，其在芽胞形成的過程中伴有蛋白晶體的形成，稱為伴
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2Y二級結構和三級結構間的比較，找出異同點，為今后進一步確定其抗癌構效關系的研究奠定基礎。

成果形式：成果以論文的形式體現(xiàn)



4、 擬解決的關鍵問題：

對突變蛋白質P11、P32的以及未突變蛋白P2Y的空間結構進行預測，以推測P11、P32、P2Y的3D空間結構，再進行P11、P32與P2Y二級結構和三級結構間的比較，找出異同點，進行分析。




5、研究思路、方法和步驟：

運用軟件Discovery Studio Client對目標蛋白進行同源建模，具體步驟如下：
（1）搜索與目的的蛋白相匹配的模型---同源蛋白，
（2）將目的蛋白與同源蛋白進行多重序列比對，
（3）使用 MODELER產生目的序列的模型，
（4）模型的評估，
（5）數(shù)據分析。
6、本課題的進度安排：

2011年10月-11月：文獻查找及熟悉同源建模軟件
2011年11月-2011年12月：運用軟件Discovery Studio Client對目標蛋白進行同源建模
2011年12月-2012年1月：分析數(shù)據，寫論文
2012年5月-6月：論文的后期處理以及PPT的制作



7、參考文獻：

1、Crystal Structure of the Parasporin-2 Bacillus thuringiensis To*in That Recognizes Cancer Cells,J. Mol. Biol. (2009) 386, 121–133
2、Homology model of RSK2 N-terminal kinase domain, structure-based identification of novel RSK2 inhibitors, and preliminary common pharmacophore,Bioorganic & Medicinal Chemistry 14 (2006) 6097–6105
3、蛋白質結構預測實驗指南,岳俊杰，馮華，梁龍主編
4、
5、短小芽孢桿菌木聚糖酶的同源建模及分子動力學模擬,葛慧華, 李紅春, 張光亞,Journal of Huaqiao University (Natural Science),Vol.32 No.3 May.2011
6、大麻素受體CB1三維結構的同源模建及其對接研究,涂國剛 ,李少華,化學學報,Vol.69,2011 No. 8,1007～1010
7、抗癌晶體蛋白 Paras pori n2 2空間結構的研究, ……（未完，全文共2273字，當前僅顯示1444字，請閱讀下面提示信息。收藏《抗癌伴孢晶體蛋白的結構生物學（開題報告）》）