“百人計劃”研究員邱東茹事跡材料

國內(nèi)分子微生物學(xué)的頂尖引路人
——記中科院水生生物研究所“百人計劃”研究員邱東茹事跡材料

邱東茹校友1989年本科畢業(yè)于華中師范大學(xué)生物系，獲學(xué)士學(xué)位。1992年同校植物學(xué)專業(yè)碩士研究生畢業(yè)后到中科院水生所工作，任研究實習(xí)員和助理研究員，從事水生植物和凈化生物學(xué)研究。博士，研究員，學(xué)科組長，博士生導(dǎo)師。2011年獲中科院“百人計劃”資助。曾在歐、美、日多家研究開發(fā)機構(gòu)接受訓(xùn)練和從事科研工作10余年。在PNAS、AEM等國際主流期刊和國內(nèi)核心期刊上發(fā)表學(xué)術(shù)論文40余篇，其中包括SCI高頻引用論文2篇；獲得美國及國際專利兩項。主要從事細菌分子遺傳（假單胞菌、希瓦氏菌、枯草芽胞桿菌和納豆菌）和環(huán)境生物技術(shù)研究。目前正在開發(fā)病原微生物（包括細菌和真菌）檢測的基因芯片。
從環(huán)境生物學(xué)到分子微生物學(xué)
邱東茹博士早年的研究以環(huán)境生物學(xué)為主。在華中師大攻讀碩士學(xué)位期間，在陳德懋教授的指導(dǎo)下，研究了鄂東南幕阜山區(qū)種子植
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a-glutamic acids, PGA）生物合成調(diào)控機理。這期間發(fā)表SCI論文兩篇（SCI引用近20次），EI論文一篇。隨后又在Marshall大學(xué)參與美國航空航天局（NASA）項目“銅綠假單胞菌生物膜”的研究，基本闡明了假單胞菌從非粘液野生型（Non-mucoid）向大量產(chǎn)藻酸鹽（Alginate）的粘液型轉(zhuǎn)換（Mucoid conversion）的信號傳導(dǎo)機制，即環(huán)境壓力引起周質(zhì)空間變性外膜蛋白的聚集，變性外膜蛋白外露的羧基端氨基酸三聯(lián)體（如-WVF）引發(fā)周質(zhì)空間、細胞質(zhì)膜和細胞質(zhì)內(nèi)多種蛋白酶 （AlgW, MucP和Clp*P）介導(dǎo)的抗Sigma因子MucA 的切割和最終降解，釋放出質(zhì)膜外功能Sigma因子AlgU，進而調(diào)節(jié)藻酸鹽的大量合成，藻酸鹽吸收水分使細菌呈現(xiàn)粘液態(tài)（抗逆和抗免疫系統(tǒng)）。這些工作發(fā)表在“美國科學(xué)院院報”（PNAS）上。哈佛醫(yī)學(xué)院G. Pier教授在Faculty 1000 of Biology上評價和推薦此文,論文發(fā)表后的短時間內(nèi)就被SCI引用達50多次；英文專著引用3次）。邱東茹校友這期的工作還發(fā)表在“微生物學(xué)”（Microbiology, UK）、“應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)”（AEM）和“細菌學(xué)雜志”（JB）等國際微生物主流期刊上，獲得美國專利兩項。所構(gòu)建的pHERD系列質(zhì)粒為國內(nèi)外多家實驗室索取和使用（SCI引用已達30余次，包括發(fā)表在Cell和Nature上的論文）。
之后邱東茹校友前往Oklahoma大學(xué)環(huán)境基因組研究所工作，參與多項美國能源部（DOE）GTL（Genes to Life）項目課題的工作，主要研究對象為金屬還原菌Shewanella屬細菌，建立了適用于Shewanella屬細菌基因組足跡分析技術(shù)（Tn-seq），發(fā)現(xiàn)了細菌低溫適應(yīng)相關(guān)基因和新型機理。鑒定出一系列與細菌低溫適應(yīng)相關(guān)的基因。構(gòu)建了高產(chǎn)原卟啉I*的工程菌株（美國專利申請中）。
回國建立分子微生物學(xué)與生物技術(shù)實驗室
2011年邱東茹校友離開美國回國工作。在水生所組建分子微生物學(xué)與生物技術(shù)實驗室，帶領(lǐng)以年輕學(xué)者（一名實驗員、2名博士后、3名博士生和3名碩士生）為主的團隊，開展細菌無氧呼吸與低溫適應(yīng)機理、細胞質(zhì)膜外功能sigma因子、鐵氧化細菌形成黑褐色沉淀和胞外多糖的機理以及細菌溶解微囊藻的分子機理和納豆激酶等多項研究課題的研究。已取得階段性成果，篩選到兩類強殺（微囊）藻劑并開展其溶藻機理研究；發(fā)現(xiàn)鐵錳氧化細菌是造成湖北省某縣自來水中黑褐沉淀物的主要原因，分離到一株纖發(fā)菌（Leptothri*）RN12并鑒定出若干與胞外多糖合成相關(guān)的基因；揭示微氧條件下細菌硝酸鹽還原的特點和調(diào)節(jié)機制；揭示希瓦氏菌中兩個ECF sigma因子的細胞功能及調(diào)節(jié)機理。已完成多篇論文，已有三篇論文發(fā)表或被接受，其中一篇被AEM（Applied and Environmental Microbiology）接受。
近年來，邱東茹博士主持中科院“百人計劃”擇優(yōu)支持等多項重點課題。我們期望，邱東茹博士的研究工作能為我國富營養(yǎng)化湖泊和水庫有毒微囊藻水華的控制、水污染治理和工業(yè)生物技術(shù)作出應(yīng)有的貢獻。

邱東茹簡介：
邱東茹，男，1968年7月出生，湖北麻城人。現(xiàn)任中國科學(xué)院水生生物研究所研究員、學(xué)科組長（PI），中科院“百人計劃”入選者。1989年本科畢業(yè)于華中師范大學(xué)生物系，獲學(xué)士學(xué)位。1992年同校植物學(xué)專業(yè)碩士研 ……（未完，全文共2904字，當前僅顯示1846字，請閱讀下面提示信息。收藏《“百人計劃”研究員邱東茹事跡材料》）