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論文開題報告:乙醇脫氫酶定量構(gòu)效關(guān)系研究

發(fā)表時間:2013/9/8 17:54:49
目錄/提綱:……
2、通過查閱文獻,了解Bioedit、CalTool等軟件的使用
3、通過查閱文獻,查找并獲得乙醇脫氫酶的ID號及最適溫度
4、通過查閱文獻,初步了解氨基酸組成及最適溫度的關(guān)系
3、利用定量構(gòu)效關(guān)系研究乙醇脫氫酶理化參數(shù)與生物活性之間的關(guān)系
……

大學(xué)本科畢業(yè)論文(設(shè)計)開題報告
學(xué)院:  化工學(xué)院 專業(yè)班級:2009級生物工程
課題名稱 乙醇脫氫酶定量構(gòu)效關(guān)系研究

1、本課題的的研究目的和意義:

利用構(gòu)建乙醇脫氫酶氨基酸組成和最適溫度的支持向量機模型,并運用均勻設(shè)計優(yōu)化及其運行參數(shù)結(jié)構(gòu)來預(yù)測氨基酸組成和最適溫度的關(guān)系,以及利用定量構(gòu)效關(guān)系的研究來預(yù)測乙醇脫氫酶的理化參數(shù)及結(jié)構(gòu)參數(shù)與其生物活性之間的關(guān)系。

2、 文獻綜述(國內(nèi)外研究情況及其發(fā)展):
乙醇脫氫酶(EC 1.1.1.1, ADHs)又名乙醇:輔酶氧化還原酶,分布廣泛,大量存在于人和動物肝臟、植物及微生物細(xì)胞中,是一種含鋅金屬酶,具有廣泛的底物特異性。作為生物體內(nèi)主要的短鏈醇代謝的關(guān)鍵酶,它在很多生理過程中起著重要作用。目前從很多生物中都分離到。來源于微生物的乙醇脫氫酶吸引了更多的研究者的關(guān)注,這是由于它能用于合成或修飾一些高價值的
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張光亞等主成分分析的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)及其在木聚糖酶最適pH建模中的應(yīng)用。 張光亞 方柏山,木聚糖酶氨基酸組成與其最適溫度的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)數(shù)學(xué)模型,即是使用計算機模擬預(yù)測氨基酸組成與最適溫度的關(guān)系的研究。



3、 本課題的主要研究內(nèi)容(提綱)和成果形式:

主要內(nèi)容:
1、 通過查閱文獻,掌握定量構(gòu)效關(guān)系研究方法,及均勻設(shè)計法等技術(shù)的運用。
2、 通過查閱文獻,了解Bioedit、CalTool等軟件的使用。
3、 通過查閱文獻,查找并獲得乙醇脫氫酶的ID號及最適溫度。
4、 通過查閱文獻,初步了解氨基酸組成及最適溫度的關(guān)系。設(shè)計出實驗方案,根據(jù)實驗方案安排實驗。
5、 通過查閱文獻,按照文獻方法進行實驗,通過計算機模擬預(yù)測氨基酸組成與最適溫度的關(guān)系,并且用數(shù)理統(tǒng)計方法建立其理化參數(shù)與生物活性之間的定量關(guān)系,從而預(yù)測其生物活性的變化。


成果形式:以數(shù)學(xué)模型和論文的形式提交成果。


4、擬解決的關(guān)鍵問題:

1. 熟練掌握定量構(gòu)效關(guān)系和均勻設(shè)計方法等技術(shù),以及一些相關(guān)軟件的使用。
2. 利用均勻設(shè)計方法及一些優(yōu)化方法研究氨基酸組成和最適溫度之間的關(guān)系。
3. 利用定量構(gòu)效關(guān)系研究乙醇脫氫酶理化參數(shù)與生物活性之間的關(guān)系。


5、研究思路、方法和步驟:

1、查找文獻獲得乙醇脫氫酶的ID號和最適溫度,并通過NCBI查找出其氨基酸序列。
2、根據(jù)CalTool軟件找出乙醇脫氫酶的氨基酸組成及其分段氨基酸組成。
3、通過基于均勻設(shè)計的線性核函數(shù)SVM參數(shù)優(yōu)化及基于均勻設(shè)計的RBF核函數(shù)SVM參數(shù)優(yōu)化等方法進行擬合,分析乙醇脫氫酶氨基酸組成與最適溫度的關(guān)系。
4、利用定量構(gòu)效關(guān)系研究乙醇脫氫酶理化參數(shù)或結(jié)構(gòu)參數(shù)與生物活性之間的關(guān)系,以及其理化參數(shù)或結(jié)構(gòu)參數(shù)的改變,而其生物活性的改變情況。



6、本課題的進度安排:

2月24日-3月10日:查閱相關(guān)文獻,了解均勻設(shè)計方法等技術(shù),以及一些相關(guān)軟件的使用。
3月11日-4月4日:查閱相關(guān)文獻,獲得乙醇脫氫酶的ID號及其最適溫度,通過一些軟件的使用查找氨基酸序列和氨基酸組成。此外,通過一些函數(shù)擬合出氨基酸組成和其最適溫度之間的關(guān)系。
4月5日-4月25日:查閱相關(guān)文獻,根據(jù)擬合的實驗結(jié)果,選取比較適合的實驗數(shù)據(jù),根據(jù)定量構(gòu)效關(guān)系進行實驗并獲得較為準(zhǔn)確的實驗數(shù)據(jù)。
4月26日-5月10日:根據(jù)實驗結(jié)果,分析出乙醇脫氫酶的氨基酸組成與最適溫度的關(guān)系,乙醇脫氫酶的理化參數(shù)或結(jié)構(gòu)參數(shù)與生物活性之間的關(guān)系,以及理化參數(shù)或結(jié)構(gòu)參數(shù)的變化與生物活性變化之間的關(guān)系。
5月11日-5月30日:整理數(shù)據(jù),完成畢業(yè)論文并上傳論文,準(zhǔn)備答辯。


7、參考文獻:
[1] Hidehiko H, Noriho K, Yutaka K, et al. Properties of an alcohol dehydrogenase from the hyperthermophilic archaeon Aeropyrum perni* K1. J Biosci Bioeng 2004, 97(3): 202-206
[2] Reid MF, Fewson CA. Molecular characterization of microbial alcohol dehydrogenases. Crit Re ……(未完,全文共3634字,當(dāng)前僅顯示1835字,請閱讀下面提示信息。收藏《論文開題報告:乙醇脫氫酶定量構(gòu)效關(guān)系研究》
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