畢業(yè)論文：產蛋白酶菌株VV6及XH7的分類鑒定

大學本科畢業(yè)論文(設計)開題報告
學院：化工學院　　　　　　　　　　　　　專業(yè)班級：　　生物工程專業(yè)　
課題名稱 產蛋白酶菌株VV6及*H7的分類鑒定

1、本課題的的研究目的和意義：

細菌分類學是研究細菌分類理論和方法的科學，它包括（分類、命名、和鑒定)3個獨立和相關的分類學領域。細菌鑒定的應用：動、植物檢疫、食品衛(wèi)生檢驗、人類及動、植物病原診斷、環(huán)境微生物學研究。主要任務是在全面了解細菌的生物學特征的基礎上，研究它們的種類，探索其起源、演化以及與其他類群之間的親緣關系，進而提出能反映自然發(fā)展的分類系統(tǒng)，并將微生物加以分門別類。所謂分類，就是在對大量細菌進行逐一的觀察、分析和描述的基礎上，按照它們個體發(fā)育的形態(tài)、培養(yǎng)特征、生理生化特征、細胞化學組分以及分子生物學特征等一系列性狀的異同和主次，并根據它們的親緣關系和應用的方便，加以分門別類（歸納為綱、目、科、屬、種），從而制定為鑒定用的檢索表，用
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和微機系統(tǒng)，廣泛的鑒定功能，適用于臨床微生物實驗室。衛(wèi)生防疫和商標標系統(tǒng)，主要功能包括細菌鑒定、細菌藥物敏感性試驗及最低抑菌濃度（MIC）的測定等。其準確性和可靠性均已大大提高。
1675年，荷蘭商人Leeuwenhock自制了第一架顯微鏡
1753年瑞典博物學家林奈（Carolus Linnaeus）在《植物種志》一書中提出二界系統(tǒng)[2]。
1838年，德國生物學家Ehnenberg把細菌列為纖毛蟲綱，分為2個科，即單胞菌科和弧菌科，弧菌科再劃分5個屬。1857年德國植物學家Negeli將其獨立設一綱，取名為裂殖綱。
1872年，德國植物學家Cohn發(fā)表了一個新的細菌分類系統(tǒng)，根據形態(tài)特征把細菌分成4個族，每個族由1至多個屬組成。
1854年，Koch發(fā)明了固體培養(yǎng)基，從而有可能獲得純培養(yǎng)物來進行研究。
1909年，Jensen發(fā)表了一種分類法，采用形態(tài)和病原性特征，還依據細菌代謝活性，突破了純形態(tài)的分類局限，在細菌分類學上向前邁出了重要一步。
1917年，美國細菌學家協(xié)會指導和撰寫了細菌分類學著作《伯杰氏細菌鑒定手冊》（Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology）至今仍是國際上從事研究細菌學工作者必備的工具書。
20世紀40至50年代這一時期在試驗手段上只是從數(shù)量上增加生理學、生物化學的實驗及營養(yǎng)要求等。所以，這一時期的細菌分類只是量上的變化，沒有質的飛躍。在這時期中，科學家們也曾試圖建立新的分類系統(tǒng)，但由于實驗手段的限制，未能實現(xiàn)[1]。
在這同一時期中，隨著分子生物學技術的建立和日臻完善，20世紀60年代末Carl Woese和George Fo*根據所有細胞生物中均含有rRNA分子，其大小適中（約1540bp）、堿基組成保守、一級結構和高級結構高度保守、功能保守等特征，確認16S rRNA的變異不受環(huán)境影響，只是時間的函數(shù)，是度量生物進化、進化譜系分析極佳的“分子尺”。在進行了原核生物16S rRNA、真核生物18S rRNA的寡核苷酸編目檢測后，比較各類生物的rRNA特征序列，從序列差異計算出不同生物間的進化距離，繪制出系統(tǒng)發(fā)育樹（phylogenetic tree）（圖1-1）[2]。




























2、 本課題的主要研究內容（提綱）和成果形式：

主要內容：本課題主要對分離自北極的蛋白酶產生菌株VV6和VV7進行分類鑒定，探索其系統(tǒng)進化地位。實驗內容包括細菌形態(tài)特征觀察、生理生化特征實驗、DNA中G+C mol%測定、以及16S rRNA 基因序列分析。






成果形式：以數(shù)學模型和論文的形式提交成果。


4、擬解決的關鍵問題：

擬解決的關鍵問題：對優(yōu)化過程中若干參數(shù)的相互影響與干擾進行細致調節(jié)，努力獲得全局化考量。





5、研究思路、方法和步驟：

研究思路、方法和步驟：
1、細菌總DNA的提取
2、瓊脂糖凝膠電泳
3、感受態(tài)細胞的制備
4、感受態(tài)細胞效價
5、16S rRNA基因PCP擴增
6、PCR 產物純化
7、16S rRNA基因核酸內切酶酶切反應
8、聚丙烯酰胺凝膠電泳
9、RFLP圖譜分析
10、連接反 ……（未完，全文共5210字，當前僅顯示1829字，請閱讀下面提示信息。收藏《畢業(yè)論文：產蛋白酶菌株VV6及*H7的分類鑒定》）